植物基因组学国家重点实验室

基本信息 开放实验室名称植物基因组学国家重点实验室
类型国家重点实验室
认定部门中华人民共和国科学技术部,中国中科院认定时间2003年
依托单位中国科学院微生物研究所
所属功能平台植物基因组学平台
所属领域生物医药
负责人方荣祥
服务特色植物基因组学国家重点实验室从国家战略需求出发,以主要农作物、经济作物以及重要模式植物为材料,系统地开展植物和植物病原微生物的功能基因组学研究,着重于大规模新基因的克隆鉴定、功能分析和潜在应用价值的探索,推动植物生物技术的源头创新和转基因植物产业化。建立我国植物基因组学理论体系和技术平台,使实验室成为国内植物基因组学源头创新研究的中心,不断提高在国际上的竞争力和影响力。
研究领域: 主要以我国农作物的重要微生物病害,如植物病毒病、棉花黄萎病和十字花科植物细菌病等作为研究模式,开展病原微生物与植物相互作用分子机理、植物抗病生物技术的基础研究和应用基础研究,近期的研究重点为病原体-介体昆虫-植物三者间的相互作用。
依托国家重点实验室专项经费和中央修购项目等资助,研究室装备有种类齐全的从事植物-微生物相互作用研究的设备和装置,按中国科学院及研究所规定对外开放使用。
(1)蛋白质与激酶研究平台:纳升级液质联用仪(nano LC-LTQ XL MS),AKTA全自动纯化仪,蛋白双向电泳仪,磷屏扫描仪、多功能酶标仪、超高速离心机、离心浓缩仪等
(2)细胞生物学研究平台:高速转盘式活细胞激光共聚焦显微镜, 激光共聚焦显微镜(Leica SP8),荧光显微镜,全自动体视镜等
(3)化合物小分子研究平台:线性离子阱液质联用仪(Agilent 1260 LC-AB Qtrap4500 MS)、液相色谱仪、固相萃取仪等
(4)分子生物学通用设备:qRT-PCR仪,全自动细菌计数仪,基因枪,全自动核酸提取仪,高通量植物样品粉碎系统,大型人工气候箱等
科研队伍和骨干专家现有创新课题组8个,青年课题组3个;现有固定人员共计34人,其中正高级职称10人(含研究员9人,包括有院士1人,国家杰出青年基金获得者1人和“百人计划”引进人才4人),副高级职称8人,中级职称14人,初级职称2人。目前有博士生37人,硕士生22人,博士后5人。项目聘用、返聘、劳务、客座人员约26人。
骨干专家
1.方荣祥 研究员 中国科学院院士 研究室主任 植物基因组学国家重点实验室学术委员会主任..研究方向:1. 植物基因表达的调控机制及其在植物生物技术上的应用;2. 植物病原细菌致病相关基因的表达调控;3. 植物病毒致病因子功能分析及与寄主防卫系统的相互作用
2.钱韦 研究员 植物基因组学国家重点实验室副主任 研究室副主任兼学术秘书 研究方向:1.细菌双组分信号转导系统的信号传递与整合机制;2.寄主植物识别病原细菌的分子过程及植物抗病生物技术;3.适应性进化的分子生物学基础
科研成果目前在病原-植物互作基础研究领域做出多项重要突破。近期成果:发现黄瓜花叶病毒导致植物AGO-1介导的可变剪切、DNA甲基化等过程的关键结构;解析水稻NRR蛋白在花期调控和营养过程中的功能,并将该基因用于菊花花期的生物工程改造;利用异源表达等方法,解析一个盐芥叶绿体蛋白在植物耐氧胁迫过程中的重要作用;阐明一个水稻miRNA在根系发育和营养调控过程中的新功能。
代表仪器设备

名称1:

液相色谱-质谱联用仪

原值(万元)

191

厂商及型号

液相色谱:Agilent 1260

质谱:AB Qtrap 4500

主要性能参数

质量范围m/z5--2000 amu。扫描速度15000  amu/sec

分辨率:15000 (FWHM)

串联质谱功能:具有MS/MSMS/MS/MS功能,一次进样同时获得MRM 定量图谱及各组分子离子二级/三级全扫描质谱图.

质量稳定性:0.1 amu/24 hrs

定量范围:6个数量级

MRM定量灵敏度:重复10次进样 CV<5%ESI(+)  200 fg利血平   S/N>1500:1

 

功能用途

小分子化合物定性定量检测

名称2:

高速转盘式活细胞激光共聚焦显微镜

原值(万元)

254.8

厂商及型号

PE公司 Ultraview Vox

主要性能参数

高速激光共聚焦扫描头 CSU-X1

增强型Nipkow微透镜双转盘,配有两万个精准对齐的微透镜和针孔,转盘转速维持5000rpm稳定运行;

共聚焦激光光源:全固态激光器及激光耦合系统

二极管激光器:波长:405nm,

半导体泵浦或光泵浦固体激光器:波长:488nm,561nm。

功能用途

用于固定细胞及组织的荧光观察分析和活细胞实时的高分辨率、高速、高灵敏度共聚焦成像以及光漂白后荧光恢复(FRAP)、荧光漂白消失(FLIP)分析


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